新潟大学 社会連携推進機構

医療・健康・福祉
2025.04.22

タンパク質の安定化置換体の理論予測法の開発

~ 水の効果に着目した超高速探索法 ~
工学部 人間支援感性科学プログラム 生物物理学研究室
林 智彦
林 智彦
HAYASHI Tomohiko
自然科学系 准教授
専門分野
生物物理・化学物理・ソフトマターの物理、計算科学、溶液論
キーワード
機能性材料、タンパク質の安定化メカニズム、酵素、創薬、タンパク質-タンパク質間相互作用
関連URL
http://www.eng.niigata-u.ac.jp/~human/

研究の目的、概要、期待される効果

 タンパク質などの生体分子は、水中で固有の立体構造に「折りたたむ」ことで安定な状態を保っています. これをさらに安定化させることで、厳しい環境でも機能する酵素の開発や、構造解析が困難な創薬標的タンパク質の結晶化促進など、産業・医学・薬学の幅広い分野への活用が期待出来ます。
 私たちは、生体分子の周りに「大量に存在する水分子」の物理的な意味・役割に着目して、タンパク質の安定化メカニズムを説明・予測することが可能な、独自の理論手法を開発してきました。 これまでに、100種類以上のタンパク質の天然構造予測に成功し、さらに、置換体の安定性を予測する手法¹の開発を続けてきました。この手法では、水中のみならず、アルコールや疎水性溶媒、さらには生体膜中など、あらゆる「環境」の物理特性を分子レベルでモデリングして、タンパク質の安定性を高速評価することが出来ます。² 既に、幾つかのタンパク質の耐熱化に成功するなど、多くの成果を上げています。³

 今後は、受容体タンパク質を安定化・不安定化するリガンドの予測や、タンパク質-タンパク質相互作用の安定化メカニズムからヒントを得た、新しいタイプの創薬技術・機能性材料の開発などへの応用・展開を目指しています。

関連する知的財産論文等

  • 1) S. Murakami, H. Oshima, T. Hayashi, and M. Kinoshita, J. Chem. Phys. 143, 125102 (2015).
  • 2) T. Hayashi, M. Inoue, Y. Yasuda, E. Petretto, T. Škrbić, A. Giacometti, and M. Kinoshita, J. Chem. Phys. 149, 045105 (2018).
  • 3) T. Murata, Y. Yasuda, T. Hayashi, and M. Kinoshita, Biophys. Rev. 12, 323 (2020).

アピールポイント

タンパク質1分子の安定性をわずか1秒未満で評価することが可能です。 にもかかわらず、理論計算に使うコンピュータは、ごく一般的なワークステーションやパソコンでもOKです。

つながりたい分野

  • ・バイオ・医薬品・化学関連企業
  • ・生体分子の活性や機能性材料の性質などを、分子レベルの知見により改善・応用することに興味のある企業、研究所、自治体等

お問い合わせは新潟大学社会連携推進機構ワンストップカウンターまで

onestop@adm.niigata-u.ac.jp
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